Dr. Koenen doet momenteel onderzoek naar de ontstekingsfuncties van bloedplaatjes, hun microvesikels en de rol van bepaalde ontstekingsmoleculen bij vaatziekten, b.v. trombose en atherosclerose. Een lopend VIDI-project heeft bijvoorbeeld tot doel de moleculaire aspecten van chemokine RANTES en de secretie van bloedplaatjesfactor 4 door bloedplaatjes en het belang ervan bij de ontwikkeling van hart- en vaatziekten te karakteriseren.